pH

Wskaźnik pH kału jest interpretowany w kontekście pozostałych informacji na temat stanu biocenozy jelit. Sam w sobie jest wskaźnikiem nieswoistym, co oznacza że nie dostarcza bezpośrednio informacji o przyczynie zaburzenia. Wzrost pH kału powyżej normy zwykle wiąże się ze spadkiem aktywności dobroczynnych bakterii komensalnych i przerostem flory niefermentacyjnej. Może się wiązać ze stosowaniem antybiotyków lub innych leków uszkadzających mikrobiotę. W tym przypadku zwykle koreluje z przerostem C. difficile. Przyczyna może być również stan zapalny bądź stan nowotworowy jelit.